| # | Jugador | Equipo | Goleadores |
|---|---|---|---|
| 1 | A. Kronus |  MFK Karviná | 7 |
| 2 | D. Jurcenko |  SK Kladno | 6 (2) |
| 3 | P. Juritka |  SFC Opava | 6 (1) |
| 4 | O. Tessilimi |  Football Klub Dukla Praga | 5 |
| 5 | R. Mikus | Football Klub Dukla Praga | 5 (1) |
| 6 | T. Omotoye |  FC Vysočina Jihlava | 5 |
| 7 | B. Djordjic |  FC Graffin Vlašim | 4 (1) |
| 8 | F. Idumbo-Muzambo |  FK Ústí nad Labem | 4 |
| 9 | J. Hrubes | FC Graffin Vlašim | 4 |
| 10 | J. Malek |  1. FK Příbram | 4 (1) |
| 11 | J. Matousek |  Prostějov | 4 (1) |
| 12 | J. Selnar | MFK Karviná | 4 |
| 13 | K. Belzik |  SK Slavia Praga II | 4 (1) |
| 14 | L. Havel |  FC Silon Táborsko | 4 |
| 15 | R. Dedic |  FK Třinec | 4 (1) |
| 16 | S. Pikolon | FC Graffin Vlašim | 4 |
| 17 | A. Cedergren | SK Slavia Praga II | 3 |
| 18 | A. Conte | 1. FK Příbram | 3 |
| 19 | A. Imrana | Prostějov | 3 |
| 20 | B. Labaran Khalid | FC Vysočina Jihlava | 3 |
| 21 | B. Lacik | SFC Opava | 3 |
| 22 | D. Gembicky | SK Kladno | 3 |
| 23 | D. Huf |  FK Viktoria Žižkov | 3 |
| 24 | D. Samko | MFK Karviná | 3 |
| 25 | F. Do Marcolino | FK Ústí nad Labem | 3 |
| 26 | J. Dufek | FC Graffin Vlašim | 3 |
| 27 | J. Kolisek | SK Slavia Praga II | 3 |
| 28 | J. Pira | MFK Karviná | 3 |
| 29 | L. Dvoracek |  FC Baník Ostrava II | 3 |
| 30 | L. Fila | 1. FK Příbram | 3 |
Según los eventos de los partidos